성 베네딕도는 수도규칙을 저술하기는 했지만 구체적인 조직을 가진 수도회를 세우지는 않았습니다. 각 수도원은 독립되어 있으며, 스스로 선출한 아빠스 밑에서 공동생활을 했습니다. 그러나 후대로 오면서 세속적 권세의 영향력으로부터 수도원의 독립을 보장하고 규율 준수를 촉진하기 위하여 많은 수도원들이 서로 유대를 맺었습니다. 이와 같이 성 베네딕도의 수도규칙을 지키는 수도원들의 연합으로 성 베네딕도회(O.S.B). 시토회(O.Cist), 엄률시토회(O.C.S.O., 트라피스트회) 등 여러 수도회가 생겼습니다.
상호 느슨한 연대를 유지하고 있던 성 베네딕도회 수도원들은 1893년, 레오 13세의 명령으로 13개 연합회를 구성원으로 하는 베네딕도회 총연합으로 결합되었습니다. 2025년 통계에 따르면, 베네딕도회 총연합에는 19개의 연합회가 가입되어 있고 5천8백여 명의 수도자들이 속해 있습니다. 베네딕도회 총연합의 수장은 수석 아빠스이며, 연합회 총재 혹은 총 아빠스가 각 연합회를 이끌고 있습니다.
자치수도원은 아빠스좌 수도원 혹은 원장좌 수도원으로 나뉘며, 명칭에 따라 아빠스나 원장이 수도원의 장상직을 수행합니다. 자치수도원들은 행정, 인사, 재정 분야에서 완전한 자치를 누리지만 연합회 회헌에 따라서 총재 아빠스의 지시를 받는 수도원들도 있습니다. 전 세계 베네딕도회 수도원 장상들은 4년마다 한 번씩 베네딕도회 총연합 본부인 로마 성 안셀모 수도원에 모여 회의를 개최합니다.
이 회의의 기능은 수도회 현안에 대해 논의하고 수석 아빠스를 선출하는 것입니다. 수석 아빠스는 성 안셀모 수도원에 상주합니다. 성 안셀모 수도원 안에는 전세계 베네딕도회원들의 양성과 학문연구를 위해 1886년에 설립된 성 안셀모 대학이 있습니다. 성 안셀모 대학에는 신학부, 철학부, 그리고 교황청립 전례연구소가 설치되어 있습니다.
